يتألف عمل بناء القدرات في مشروع ابتكار من خطوات مختلفة، تبدأ بتدريب عام لتطوير المهارات الأفقية. يستهدف التدريب كل من الموظفين الأكاديميين والإداريين في الجامعات الليبية المستفيدة، ويهدف إلى تعزيز المهارات العرضية لأعضاء هيئة التدريس، مثل التواصل والتفكير النقدي وكتابة المقترحات والإدارة المالية والإدارية وإدارة مشاريع البحث وأدوات إدارة المشاريع والمزيد.

يعتمد تدريب المهارات الأفقية على أصلين رئيسيين: أسبوع تدريبي كامل في الحضور وعدد من الدورات التدريبية والندوات عبر الإنترنت التي يتم تقديمها بطريقة متزامنة وغير متزامنة. يبلغ عدد المتدربين من الجامعات الشريكة حوالي 80 من 11 مؤسسة، مع حوالي 15٪ من النساء.